Kanë kaluar dy vjet nga përfundimi i Luftës së Katërt të Madh të Ninjave. Konohagakure ka mbetur në një gjendje paqeje dhe harmonie - derisa Hokage i Gjashtë Kakashi Hatake vëren se hëna po i afrohet në mënyrë të rrezikshme Tokës, duke paraqitur kërcënimin e shkatërrimit planetar. Në mes të sprovës së rëndë, Konoha pushtohet nga një e keqe e re, Toneri Oosutuski, i cili papritmas rrëmben motrën e vogël të Hinata Hyuuga, Hanabi. Kakashi dërgon një ekip të aftë ninja të përbërë nga Naruto Uzumaki, Sakura Haruno, Shikamaru Nara, Sai dhe Hinata në një përpjekje për të shpëtuar Hanabi nga kthetrat djallëzore të Tonerit. Megjithatë, gjatë misionit të tyre, skuadra përballet me disa pengesa që i sfidojnë ata, duke i prishur përpjekjet e tyre. Me rrëmbimin e saj, testohen marrëdhëniet që ndan ekipi me njëri-tjetrin, dhe me botën që po arrin në prag të shkatërrimit, ata duhet të garojnë me kohën për të siguruar sigurinë e planetit të tyre. Ndërkohë, ndërsa beteja pason, Naruto shtyhet të luftojë për diçka më të madhe nga sa e ka imagjinuar ndonjëherë - dashurinë.