Vëllezërit Rin dhe Yukio shkojnë në liqenin Towada në Aomori për të kërkuar Shura, e cila ishte zhdukur papritmas. Atje, ata gjejnë vendlindjen e Shura - vendin ku Shiro u bë kujdestari i saj. Ndërsa kërkimi i tyre vazhdon, Rin dhe Yukio zbulojnë fatin që e pret Shura. Ndërkohë, Rrufeja, një nga Kalorësit e Harkut, mbërrin në Degën në Japoni të Kalorësve të Kryqit të Vërtetë dhe fillon hetimin e tij ndaj Iluminatit. Rrufeja nxjerr përfundimin se gjithçka filloi në "Nata Blu", ndërsa ai gradualisht hyn në anën e errët të Kalorësve të Kryqit të Vërtetë.